Budući da DdNTP imaju molekul vodonika (-H) umjesto hidroksilne grupe (-OH) vezan za 3'-C svoje deoksiriboze, ne može se vezati ni za jedan dolazni nukleotid. Stoga, dodavanje DdNTP-a tokom replikacije DNK može se koristiti za prekid reakcije sinteze.
Zašto se sinteza DNK zaustavlja kada se ddNTP ugradi u rastući lanac DNK?
Ako je dodani nukleotid "dideoksinukleotid" (slika 6.29), 3' kraj rastućeg niza će sada imati H, a ne OH. Ovo će spriječiti dodavanje bilo kakvih dodatnih nukleotida; tj. in vitro sinteza DNK će se zaustaviti u ovom trenutku.
Kako ddNTP prekida sintezu DNK?
Kada se ddNTP ugradi u lanac nukleotida, sinteza se prekida. To je zato što ddNTP molekuli nedostaje 3' hidroksilna grupa, koja je potrebna da formira vezu sa sljedećim nukleotidom u lancu.
Zašto DdNTP prekidaju proces replikacije?
Laboratorijske metode u enzimologiji: DNK
Dideoksinukleotid trifosfati se lako ugrađuju u rastući lanac DNK, ali im nedostaje 3′ hidroksilna grupa neophodna da bi se lanac nastavio, i efektivno prekinuti polimerizaciju.
Zašto dideoksinukleotidi uzrokuju zaustavljanje replikacije DNK?
Ovim ddNTP nedostaje 3′-OH grupa koja je potrebna za formiranje fosfodiestarske veze između dvanukleotidi, uzrokujući zaustavljanje produžetka lanca DNK kada se doda ddNTP.
