U molekularnoj biologiji, STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) je biološka baza podataka i web resurs poznatih i predviđenih interakcija protein-protein. … Najnovija verzija 11b sadrži informacije o oko 24,5 miliona proteina iz više od 5000 organizama.
Koja je svrha STRING baze podataka?
STRING baza podataka ima za cilj prikupljanje i integraciju ovih informacija, konsolidacijom poznatih i predviđenih proteina–podataka o povezanosti proteina za veliki broj organizama.
Šta je STRING rezultat?
U STRING, svaka interakcija protein-protein je označena jednim ili više 'bodova'. Važno je da ovi rezultati ne ukazuju na snagu ili specifičnost interakcije. Umjesto toga, oni su indikatori povjerenja, tj. kolika je vjerovatnoća da STRING ocijeni da je interakcija istinita, s obzirom na dostupne dokaze.
Zašto proteini interaguju?
Protein-proteinske interakcije (PPI) su fizički kontakti visoke specifičnosti uspostavljeni između dva ili više proteinskih molekula kao rezultat biohemijskih događaja vođenih interakcijama koje uključuju elektrostatičke sile, vodonik vezivanje i hidrofobni efekat.
Šta je funkcionalna asocijacija?
definicija. Binarni odnos između bioloških entiteta kada jedan od njih modulira drugog u smislu funkcije, ekspresije, degradacije ili stabilnosti drugog i odnosaizmeđu partnera ne može se utvrditi kao direktni, tako da su međukoraci implicitno prisutni.
