Agarozni gelovi se koriste sa DNK, zbog veće veličine biomolekula (fragmenti DNK su često hiljade kDa). Za proteinske gelove, poliakrilamid daje dobra rezolucija, jer je daleko manja veličina (tipično 50 kDa) pogodnija za uže međumolekularne praznine gela.
Koja je razlika između elektroforeze u agaroznom gelu i elektroforeze u poliakrilamidnom gelu?
Glavna razlika između agaroze i poliakrilamida je u tome što se agaroza koristi u elektroforezi agaroznog gela (AGE) uglavnom za odvajanje DNK, dok se poliakrilamid koristi u poliakrilamidnom gelu elektroforeza (PAGE) uglavnom za odvajanje proteina.
Zašto su poliakrilamidni gelovi bolji od agaroznog gela?
Poliakrilamidni gelovi imaju sljedeće tri glavne prednosti u odnosu na agarozne gelove: (1) Njihova moć razlučivanja je tolika da mogu odvojiti molekule DNK čije se dužine razlikuju za samo 0,1% (tj. 1 bp na 1000 bp). (2) Mogu prihvatiti mnogo veće količine DNK od agaroznih gelova.
Zašto se poliakrilamid koristi umjesto agaroze pri karakterizaciji proteina?
Poliakrilamid i agaroza su dvije potporne matrice koje se obično koriste u elektroforezi. … Agaroza ima veliku veličinu pora i pogodna je za odvajanje nukleinskih kiselina i velikih proteinskih kompleksa. Poliakrilamid ima manju veličinu pora i idealan je zarazdvajanje većine proteina i manjih nukleinskih kiselina.
Zašto se koristi poliakrilamidni gel?
Elektroforeza na poliakrilamidnom gelu (PAGE) se rutinski koristi za analizu proteina, a može se koristiti i za odvajanje fragmenata nukleinske kiseline manjih od 100 bp. Nukleinske kiseline se obično analiziraju korištenjem kontinuiranog puferskog sistema gdje postoji konstantan sastav pufera, pH i veličina pora u cijelom gelu.
