Prolin se često nalazi na kraju α heliksa ili u zavojima ili petljama. Za razliku od drugih aminokiselina koje postoje gotovo isključivo u transformaciji u polipeptidima, prolin može postojati u cis konfiguraciji u peptidima.
Da li alfa spirale sadrže ostatke prolina?
Sada kada postoji preko 30.000 proteinskih struktura u banci podataka o proteinima, jasno je da su prolinski ostaci prisutni u α-heliksima, gdje često igraju važnu ulogu u strukturi i funkciji proteina.
Koje su aminokiseline u alfa spiralama?
Bilo koja od 20 aminokiselina može učestvovati u α-heliksu, ali neke su preferiranije od drugih. Ala, Glu, Leu i Met se najčešće nalaze u spiralama, dok je manje vjerovatno da će se Gly, Tyr, Ser i Pro vidjeti.
Da li beta listovi sadrže prolin?
Proline nije omiljen u strukturama beta listova jer ne može dovršiti mrežu H-vezivanja. Kada se prolin ipak pojavi u listovima, on može biti u ispupčenju ili rubu ploče gdje nedostatak donera amino vodikove veze nije kritičan.
Šta sadrži alfa spirale?
Alfa spirala (α-helix) je uobičajen motiv u sekundarnoj strukturi proteina i predstavlja desnu heliks konformaciju u kojoj svaka kičma N-H grupa vodik vezuje se za okosnicu C=O. grupa aminokiselina koja se nalazi četiri ostatka ranije duž proteinske sekvence.