Uhvatom konformacije hromozoma?

Sadržaj:

Uhvatom konformacije hromozoma?
Uhvatom konformacije hromozoma?
Anonim

Metode zasnovane na hvatanju konformacije hromozoma (3C) otkrivaju organizaciju hromozoma unutar jezgra određivanjem fizičke blizine parova tačaka duž hromatina. Oni čuvaju interakcije hromatina umrežavanjem praćenim fragmentacijom, ligacijom i sekvencioniranjem interakcijskih regija.

Kako funkcionira snimanje konformacije hromozoma?

Chromosome conformation capture-on-chip (4C) hvata interakcije između jednog lokusa i svih drugih genomskih lokusa. Uključuje drugi korak ligacije, kako bi se stvorili samo-cirkularizirani DNK fragmenti, koji se koriste za izvođenje inverznog PCR-a. … Na jednom mikromrežu može se analizirati otprilike milion interakcija.

Šta je hvatanje konformacije hromatina?

Chromatin Conformation Capture (3C) je važna tehnika koja se koristi za proučavanje strukture hromatina, kao i osnova za nekoliko drugih derivativnih tehnika. … Protokol uključuje formaldehidno umrežavanje ćelija praćeno izolacijom hromatina i varenjem sa restrikcijskim enzimom.

Kako funkcionira Hi-C sekvenciranje?

Hi-C pristup proširuje 3C-Seq za mapiranje hromatinskih kontakata u cijelom genomu, a također je primijenjen na proučavanje in situ interakcija hromatina. U ovoj metodi, kompleksi DNK-protein su umreženi formaldehidom. Uzorak je fragmentiran, a DNK je ekstrahirana, vezana i digestirana restrikcijskim enzimima.

Šta je Hi-C tehnika?

Klasična Hi-C tehnika uključuje restrikcionu digestiju formaldehidnog umreženog genoma sa restrikcijskim enzimima specifičnim za sekvencu, nakon čega slijedi popunjavanje i popravak probavljenih krajeva uz inkorporaciju nukleotidi vezani za biotin. Popravljeni krajevi se zatim ponovo povezuju.

Preporučuje se: