Arabinoza je šećer sa pet ugljika koji je široko rasprostranjen u prirodi i može poslužiti kao jedini izvor ugljika u mnogim bakterijama. Proteinski proizvodi iz tri gena (araB, araA i araD) potrebni su za razgradnju arabinoze kod članova porodice Enterobacteriaceae, kao što su E. coli i S.
Šta arabinoza čini bakterijama?
Dakle, kada je arabinoza prisutna da uključi arabinozni operon, GFP se proizvodi i bakterije mogu fluorescirati. Bez arabinoze, GFP gen se ne eksprimira i nema fluorescencije. Dakle, variranjem sastava nutrijenata, istraživač može kontrolisati kada (i ako) dođe do florescencije u transformiranim bakterijama.
Koja je uloga arabinoze u bakterijskoj transformaciji?
Arabinoza deluje kao alosterički regulator AraC-a, menjajući za koja DNK mesta se vezuje i kako formira dimer. Zapamtite da je arabinoza šećer koji se katabolizira od strane proteina AraBAD operona. Kada se arabinoza doda sredini u kojoj živi E. coli, ona se čvrsto vezuje za AraC.
Zašto se koristi arabinoza?
Upotreba u biologiji
U sintetičkoj biologiji, arabinoza se često koristi kao jednosmjerni ili reverzibilni prekidač za ekspresiju proteina pod Plošepromotor u E. coli. Ovaj prekidač se može poništiti prisutnošću glukoze ili poništiti dodavanjem glukoze u mediju kulture što je oblik potiskivanja katabolita.
Kakoda li arabinoza utiče na regulaciju gena i ekspresiju u bakterijama?
Kada je prisutna arabinoza, araC opušta konfiguraciju DNK tako da može doći do transkripcije, ali kada je ovaj ugljikohidrat odsutan, isti protein ograničava DNK kako bi smanjio njenu sposobnost vezivanja sa RNA polimerazom.
