BLAST se može koristiti u nekoliko namjena. To uključuje identifikaciju vrsta, lociranje domena, uspostavljanje filogenije, DNK mapiranje i poređenje. Uz korištenje BLAST-a, moguće je da možete ispravno identificirati vrstu ili pronaći homologne vrste.
Za šta se koristi BLAST?
BLAST je kompjuterski algoritam koji je dostupan za korištenje online na web stranici Nacionalnog centra za biotehnološke informacije (NCBI), kao i na mnogim drugim stranicama. BLAST može brzo uskladiti i uporediti DNK sekvencu upita sa bazom podataka sekvenci, što ga čini kritičnim alatom u tekućim genomskim istraživanjima.
Šta je BLAST tehnika?
Tehnika BLAST je metoda rješavanja žalbi koju je razvio Albert Barneto . Mnemonika je skraćenica za Vjerujte, Slušajte, Izvinite se, Zadovoljite i Hvala (Tabela 1). 6. Ovaj članak opisuje njegovu korisnost u njezi pacijenata i kao kliničko nastavno sredstvo.
Kako BLAST radi na DNK?
Kako BLAST radi? BLAST identifikuje homologne sekvence koristeći heuristički metod koji inicijalno pronalazi kratka podudaranja između dve sekvence; stoga, metoda ne uzima u obzir cijeli prostor sekvence. Nakon početnog meča, BLAST pokušava započeti lokalna poravnanja od ovih početnih utakmica.
Zašto je BLAST brži od Faste?
U smislu složenosti algoritma izvođenja, BLAST je brži od FASTA pretragom samo značajnijih obrazaca usekvence. Osetljivost (ili tačnost) BLAST-a i FASTA-e ima tendenciju da bude različita za sekvence nukleinskih kiselina i proteina (https://www.bioinfo.se/kurser/swell/blasta-fasta.shtml).
