Nasuprot tome, većina eukariotskih DNK ligaza, zajedno sa arhealnim i bakteriofagnim enzimima, spadaju u drugu pod-porodicu; ovi enzimi koriste ATP kao kofaktor.
Da li je za ligaze potreban ATP?
Uobičajeno se koriste dvije DNK ligaze. … T4 ligaza zahtijeva ATP dok E. coli ligaza zahtijeva NAD+ (Nikotinamid adenin dinukleotid je koenzim koji se sastoji od 2 nt spojene preko svojih fosfatnih grupa). Oba kataliziraju spajanje 5′-fosfatne i 3′-OH grupe kako bi se formirala fosfodiesterska veza.
Zašto je ligazama potreban ATP?
Dva koraka reakcije ligacije DNK
Sama reakcija ligacije DNK ima dva osnovna koraka. Prvo krajevi DNK moraju se slučajno sudariti i ostati zajedno dovoljno dugo da im se ligaza pridruži. … Da bi se enzim omogućio da izvrši dalje reakcije, AMP u aktivnom mjestu enzima mora biti nadopunjen ATP-om.
Koje su funkcije ligaza?
DNK ligaze igraju esencijalnu ulogu u održavanju genomskog integriteta spajanjem lomova u fosfodiestarskoj kičmi DNK koji nastaju tokom replikacije i rekombinacije, a kao posljedica oštećenja DNK i njenog popraviti. Tri ljudska gena, LIG1, LIG3 i LIG4 kodiraju ATP zavisne DNK ligaze.
Šta su ligaze da li rade aktivno ili pasivno?
DNK ligaza je aktivna tokom replikacije, procesa popravke i rekombinacije DNK. Široko se primjenjuje u popravci jednolančanihlomovi u dupleks DNK živih organizama koristeći komplementarni lanac dvostruke spirale kao šablon, dok neki oblici mogu posebno popraviti dvolančana oštećenja.
