Glavni igrač u katalitičkom mehanizmu u serinskim proteazama je katalitička trijada katalitička trijada Katalitička trijada je skup od tri koordinirane aminokiseline koje se mogu naći u aktivnim mjesto nekih enzima. Katalitičke trijade se najčešće nalaze u enzimima hidrolaze i transferaze (npr. proteaze, amidaze, esteraze, acilaze, lipaze i β-laktamaze). https://en.wikipedia.org › wiki › Catalytic_triad
Katalitička trijada - Wikipedia
. … Serin ima -OH grupu koja može djelovati kao nukleofil, napadajući karbonil ugljik cisilne peptidne veze supstrata.
Kako djeluju inhibitori serinske proteaze?
Inhibitori serinske proteaze, ili serpini, sastoje se od porodice proteina koji antagoniziraju aktivnost serinskih proteaza. … U ovom mehanizmu, serpin predstavlja peptidnu sekvencu koja oponaša supstrat – petlju reaktivnog centra – svojoj ciljnoj serinskoj proteazi.
Koju ulogu u mehanizmu reakcije serinske proteaze igra sistem releja punjenja?
Uloga Asp102 u katalitičkom relejnom sistemu serinskih proteaza se teoretski proučava izračunavanjem profila slobodne energije jedne reakcije prijenosa protona od strane mutantnog tripsina Asn102 i usklađena reakcija dvostrukog prijenosa protona (tzv. mehanizam releja punjenja) divljeg tipa tripsina.
Šta od sljedećeg je primjer serinske proteaze?
Chymotrypsin: >Koristi se kao primjer serinske proteaze jer su njena struktura i mehanizam dobro shvaćeni.
Koji su razlozi naziva serinskih proteaza?
One se zovu serinske proteaze iz dva razloga:
- Oni hidroliziraju proteine.
- Oni imaju esencijalni Ser ostatak na aktivnom mjestu koji je kritičan za katalizu. U stvari, ovaj Ser je mnogo reaktivniji od ostalih serina u proteinu.